据台湾《联合晚报》报道，在马英九拍板下，台当局“海巡署”耗资百亿新台币筹建8艘配备直升机飞行甲板的巡防舰，甲板就花了新台币3亿余元新台币，但审计部门却指出，其中6艘新舰飞行甲板长度不足，未来海用型黑鹰直升机无法降落；而2艘3000吨级救难舰的直升机库，宽度竟太窄，预定配合执勤的空勤总队海豚直升机，进不了机库。

在机、舰无法组合情况下，直升机无法降落海巡舰，造成飞行甲板闲置。“海巡署”回应指出，该署9月将依支持协议，请海军支持训练直升机落舰指挥人员，预定11月15日在即将交船的3000吨级宜兰舰上，首度进行海豚直升机降落作业。

当局拨付百亿元新台币给海巡部门打造新舰，最主要的战略目标，是要让海巡舰艇火力加大，且直升机可以随舰执勤，建立三度空间立体巡防能量。但审计部门却发现，洋巡总局在舰艇上的20机炮，有4个海巡队近两年根本未曾实弹射击；巨资所建构新舰，飞行甲板却无法让黑鹰直升机降落，机库停不进直升机，相当离谱。

审计部门送到“立法院”的总决算审核报告中指出，空勤总队有10架AS-365海豚直升机，军方未来移拨空勤总队的15架黑鹰直升机，其中也有6架规划用于海上救难。而黑鹰直升机机身长度19.76米，但“海巡署”兴建8艘新舰中，除两艘3000吨救难舰有24.5米的飞行甲板可停降黑鹰，其余1000、2000吨级舰飞行甲板，仅17.9到19米，长度不足，黑鹰直升机无用武之地。

审计部门还指出，海豚机旋翼片长11.94米，海巡3000吨级救难舰机库宽度只有6米，直升机旋翼要折迭才能进机库，但空勤总队不会折迭旋翼，没训练，也没工具，3000吨级巡防救难舰机库有虚设疑虑。而据指出，“海巡署”2000吨级巡防舰直升机库，同样面临这个问题。